De flesta STR:er finns i de icke-kodande regionerna, medan endast cirka 8 % befinner sig i de kodande regionerna (3). Dessutom varierar deras densitet något mellan kromosomerna. Hos människor har kromosom 19 den högsta tätheten av STR (4). I genomsnitt förekommer en STR per 2 000 bp i det mänskliga genomet (5).
Var kan jag hitta korta tandemupprepningar?
DNA-separationerEfter PCR-amplifiering mäts den totala längden av STR-amplikonet för att bestämma antalet upprepningar som finns i varje allel som finns i DNA-profilen. Denna längdmätning görs via en storleksbaserad separation som involverar gel- eller kapillärelektrofores (CE).
Var hittas tandemupprepningar?
Tandemupprepningar inträffar i DNA när ett mönster av en eller flera nukleotider upprepas och upprepningarna ligger direkt intill varandra. Flera proteindomäner bildar också tandemupprepningar inom sin primära aminosyrastruktur, såsom bältdjursupprepningar.
Hur många korta tandemupprepningar finns det?
Under 1997 nominerade Federal Bureau of Investigation (FBI) 13 autosomala STR-loci för att utgöra kärnan i det kombinerade DNA-indexsystemet (CODIS), en databas som består av profiler bidragit från federala, statliga och lokala krimin altekniska laboratorier.
Har alla samma korta tandemrepetitioner?
Undersökning av dessa icke-kodande regioner avslöjar upprepade enheter av DNA som varierar i längd mellan individer. Forskare har funnit att en viss typ av upprepning, känd som en kort tandemupprepning (STR), är relativt lätt att mäta och jämföra mellan olika individer