1.1 α-Helices. α-helixen är ett vanligt element i proteinets sekundära struktur, som bildas när aminosyror "vindar upp" för att bilda en högerhänt helix där sidokedjorna pekar ut från den centrala spolen (Fig. 3.1A, B).
Vad får alfaspiraler att bildas?
Alfa-helixen kännetecknas av en snäv högervridning i aminosyrakedjan som gör att den bildar en stavform. Vätebindningar mellan vätet i en aminogrupp och syret i en karboxylgrupp på aminosyran orsakar denna struktur.
Hur bildas alfaspiraler och betaark?
Alfahelixen bildas när polypeptidkedjorna vrider sig till en spiral Detta gör att alla aminosyror i kedjan kan bilda vätebindningar med varandra.… Det betaveckade arket är polypeptidkedjor som löper längs med varandra. Det kallas det veckade lakanet på grund av det vågliknande utseendet.
Vilka aminosyror bildar helixar?
Olika aminosyrasekvenser har olika benägenhet att bilda α-helixstruktur. Metionin, alanin, leucin, glutamat och lysin oladdat ("MALEK" i aminosyrakoderna med 1 bokstäver) har alla särskilt hög spiralbildande benägenhet, medan prolin och glycin har dålig spiralbildande benägenhet.
Hur bildas den sekundära proteinstrukturen från den primära strukturen?
Ett proteins primära struktur definieras enbart av dess aminosyrasekvens och konstrueras av peptidbindningar mellan intilliggande aminosyrarester. Sekundär struktur är resultatet av vätebindning längs polypeptidryggraden, vilket resulterar i alfa-helixar och beta-veckade ark.