Logo sv.boatexistence.com

Vad är bigwig-fil?

Innehållsförteckning:

Vad är bigwig-fil?
Vad är bigwig-fil?

Video: Vad är bigwig-fil?

Video: Vad är bigwig-fil?
Video: Love & War - Yellow Claw (Remix) (feat. Yade Lauren) 2024, Juni
Anonim

BigWig är ett filformat för visning av tät, kontinuerlig data i ett genomwebbläsarspår, skapat genom konvertering från Wiggle-format (WIG). BigWig-formatet beskrivs på UCSC Genome Bioinformatics webbplats, och Broad Institutes filformatguide ger ytterligare information.

Vad är bigWig-format?

BigWig-formatet är för visning av tät, kontinuerlig data som kommer att visas som en graf BigWig-filer skapas initi alt från filer av WIG-typ, med hjälp av UCSC-programmet wigToBigWig. Alternativt kan bigWig-filer skapas från bedGraph-filer med hjälp av UCSC-programmet bedGraphToBigWig.

Hur använder jag bigWig-filen?

Flytta den nyskapade bigWig-filen (myBigWig.bw) till en webbtillgänglig http, https eller ftp-plats. Klistra in webbadressen i det anpassade spårets inmatningsformulär eller skapa ett anpassat spår med en enda spårlinje. Klistra in den anpassade spårraden i textrutan på sidan för anpassad spårhantering.

Vad är ett bigWig-spår?

bigWig-spår är spår för kontinuerliga signaler över hela genomet. De är lämpliga för att visa olika "råa" experimentresultat såsom ChIP-Seq-signaler, RNA-Seq-signaler, etc.

Hur skapar jag en bigWig-fil?

Det finns flera sätt att generera stora filer. Detta innebär vanligtvis att konvertera en. bam-fil till ett wiggle-spår (. wig) och sedan konvertera wiggle-spåret till en binär bigwig (.

Rekommenderad: