BigWig är ett filformat för visning av tät, kontinuerlig data i ett genomwebbläsarspår, skapat genom konvertering från Wiggle-format (WIG). BigWig-formatet beskrivs på UCSC Genome Bioinformatics webbplats, och Broad Institutes filformatguide ger ytterligare information.
Vad är bigWig-format?
BigWig-formatet är för visning av tät, kontinuerlig data som kommer att visas som en graf BigWig-filer skapas initi alt från filer av WIG-typ, med hjälp av UCSC-programmet wigToBigWig. Alternativt kan bigWig-filer skapas från bedGraph-filer med hjälp av UCSC-programmet bedGraphToBigWig.
Hur använder jag bigWig-filen?
Flytta den nyskapade bigWig-filen (myBigWig.bw) till en webbtillgänglig http, https eller ftp-plats. Klistra in webbadressen i det anpassade spårets inmatningsformulär eller skapa ett anpassat spår med en enda spårlinje. Klistra in den anpassade spårraden i textrutan på sidan för anpassad spårhantering.
Vad är ett bigWig-spår?
bigWig-spår är spår för kontinuerliga signaler över hela genomet. De är lämpliga för att visa olika "råa" experimentresultat såsom ChIP-Seq-signaler, RNA-Seq-signaler, etc.
Hur skapar jag en bigWig-fil?
Det finns flera sätt att generera stora filer. Detta innebär vanligtvis att konvertera en. bam-fil till ett wiggle-spår (. wig) och sedan konvertera wiggle-spåret till en binär bigwig (.
