Homologiriktad reparation är en mekanism i celler för att reparera dubbelsträngade DNA-lesioner. Den vanligaste formen av HDR är homolog rekombination. HDR-mekanismen kan endast användas av cellen när det finns en homolog del av DNA i kärnan, mestadels i G2- och S-fasen av cellcykeln.
Hur fungerar homologiriktad reparation?
Homologiriktad reparation (HDR) är en mekanism i celler för att reparera dubbelsträngade DNA-lesioner … Andra exempel på homologiriktad reparation inkluderar enkelsträngad hybridisering och brottinducerad replikering. När det homologa DNA:t är frånvarande sker istället en annan process som kallas icke-homolog ändsammanfogning (NHEJ).
Hur fungerar homologiriktad reparation i Crispr?
Den invasiva strängen kan sedan förskjuta en sträng av den homologa DNA-duplexen och paras ihop med den andra; detta resulterar i bildningen av hybrid-DNA som hänvisas till som förskjutningsloopen (D-loopen). Detta är den avgörande punkten för HDR. Rekombinationsintermediärerna kan sedan lösas för att slutföra DNA-reparationsprocessen.
Vad är skillnaden mellan icke-homolog ändskarvning och homologiriktad reparation?
Vad är skillnaden mellan icke-homolog ändskarvning (NHEJ) och homologistyrd reparation (HDR)? … I kärnan kan NHEJ-break-ändarna ligeras utan en homolog mall, medan HDR-breaks kräver en mall för att vägleda reparationen. NHEJ är en mycket effektiv reparationsmekanism som är mest aktiv i cellen.
Hur lång tid tar homologiriktad reparation?
Här utnyttjar vi samma strategi för att utforska reaktionsmekaniken för homologiriktad reparation med en enkelsträngad DNA-givare med två armar av homologi till målplatsen. Systemet beskrivs i fig. 1 och den totala reaktionen tar ~16 timmar att slutföra.
Homology-dependent double strand break repair
